Процедура начинается с того, что пациента укладывают на кушетку в положении лежа на спине. Врач проводит предварительный осмотр горла, задает вопросы о симптомах, прошлых заболеваниях и аллергиях. В некоторых случаях, чтобы снизить дискомфорт во время процедуры, врач может применить местный анестетик в виде спрея для горла.
Затем врач аккуратно вводит эндоскоп через носовые ходы или через рот. При введении через рот пациента просят открыть рот и высунуть язык. Введение эндоскопа может вызывать небольшое покалывание или дискомфорт, но это обычно не вызывает сильной боли.